阜阳市医药科技工程学校始建于1964年，2015年6月被阜阳市人民政府批准改制为公办全日制普通中专学校。系安徽省现代农业职教集团理事单位，省级示范中等职业学校。

学校现有两个校区，校园面积226亩，建筑面积27076平方米，藏书8.7万多册，报刊杂志105种，16个校内外实习实训基地;各类实验实训设备总价值1170多万元;教职工138人，专职教师133人，其中研究生学历8人，本科学历125人，高级职称51人，各类专业课教师72人，双师型教师57人。现有45个教学班，在校生2699人。

学校先后被授予“安徽省文明单位”、“安徽省贫困地区劳动力转移培训基地”、“阜阳市平安校园”、“阜阳市职业教育先进单位”、“全省书法教育示范校”、“全国国防教育先进校”、“全国零犯罪学校”等称号，安徽省中等职业教育“省级示范特色学校建设项目”学校。近三年来，有200多位师生在省、市技能大赛中获奖;60多名学生在国家、省文明风采大赛中获奖。

学校践行“品能教育”，服务学生终身发展。坚持“凡是适合孩子的，才是最好的”办学原则，秉承“每位学生都是人才”的办学理念;通过举办“四节”，即“技能大赛节”、“读书节”、“艺术节”、“体育节”，形成了活泼向上、平安和谐的校园文化。积极开展“阜阳市网络文明示范校”创建活动，引导学生在校内科学使用手机。积极推行“三进”教学模式，即：企业进校园、师傅进课堂、学生进车间。同一专业实行分类教学，开设对口升学班和技能就业班(供学生自主选择)。对口升学班主攻本科，按大纲要求开设课程;技能就业班主攻高职和就业，通过自主招生等形式升入高职深造，通过企业冠名班实现高质量就业。