继续教育中心主要开展函授教育、自学考试、职业技能鉴定、技术培训等业务。

函授教育 函授教育始于上世纪70年代末。1979年，学院受福建省水利局委托，成立上海电力专科学校函授部福建函授辅导站。1984年，水利水电部教育司批准福建省水利厅与武汉水利电力学院联合在学校设立函授站。1985年，福建省人民政府正式批准学院设立函授部。1995年始，陆续与福建农林大学成人教育学院、福州工人业余大学联合举办大专函授。2001年，学院与武汉大学签约设立函授站。2007年，福建省教育厅批准学院独立开展大专函授教育。2012年，又与河海大学签约设立函授站。函授专升本主要有水利水电工程、电气工程及其自动化、土木工程等专业，大专函授主要有水利水电建筑工程、发电厂及电力系统、建筑工程技术、工程造价等专业。截至2017年，已毕业近7千名函授生。

技能鉴定 1994年福建省劳动局批准该院成立福建省水利电力职业技能鉴定站。1994年经国家水利部批准成立国家水利行业特有工种鉴定站。2000年，经福建省劳动厅批准学院设立全国计算机高新技术福建考试站点。目前可为29个工种开展初、中、高级技能鉴定。截至2017年，累计为近3万人次进行了职业技能鉴定。

技术培训 作为福建省人事厅定点的继续教育机构和水利行业定点培训机构，为提高职工技术水平，学院大力开展各类职业技术培训，目前共有40个培训模块。截至2017年，累计培训学员5.6万人次。