上海交通大学医学院继续教育学院(上海交通大学成人教育学院医学院分院)成立于2005年7月，前身为成立于1958年的上海第二医学院夜大学。1985年上海第二医学院改为上海第二医科大学后，上海第二医学院夜大学更名为上海第二医科大学夜大学。1996年5月，在原夜大学基础上成立上海第二医科大学成人教育学院。1997年成人教育学院分别被评为全国成人高等教育评估优秀学校和上海市成人高等教育评估优良学校。2004年10月成人教育学院更名为上海第二医科大学继续教育学院。2005年7月，上海交通大学与上海第二医科大学合并后，继续教育学院更名为上海交通大学成人教育学院医学院分院，并沿用继续教育学院名称至今。

上海交通大学医学院继续教育学院目前承担成人学历教育、继续医学教育、自学考试和全科医学培训工作。

机构设置

上海交通大学医学院继续教育学院(上海交通大学成人教育学院医学院分院)目前设三个办公室，即学历教育办公室、自学考试办公室和继续医学教育办公室，分别承担成人学历教育、自学考试和继续医学教育等工作。