昆明医科大学继续教育学院是学校所属二级学院，至今已有50多年的办学历史，主要承担成人学历教育和非学历教育工作。继续教育学院依托昆明医科大学雄厚的师资力量，为我省培养了大批留得住、用得上的技能型医学人才。1997年，学院被省教育厅评为“云南省成人高等教育优良学校”；1998年、2003年两次被省教育厅评为“云南省高等教育自学考试先进单位”。

继续教育学院始终坚持“以质量求生存，以质量求发展”的办学方针，自上世纪80年代恢复招收夜大学生以来，先后开设了高中起点专科、专科起点升本科，高中起点本科三个层次的成人学历教育。专业涵盖了临床医学、护理学、口腔医学、预防医学、康复治疗学、医学检验技术、医学影像学、药学、眼视光学、公共事业管理等多个专业学科。2016年报考我院考生为14173人，实际招生10354人，目前毕业生总人数近9万人。为满足云南省广大基层医疗卫生技术人员就近、就便接受高等教育，提升学历、提高专业知识水平的需要，昆明医科大学继续教育学院自1996年开始建立校外教学点，至今已在全省16个州（市）建立了80余个教学点。

近年来，继续教育学院积极响应学校“强化大学人才培养、科学研究和服务社会功能”的号召，不断改进工作，积极拓展办学空间，在努力抓好学历教育的基础上，积极开展岗位及职业技能培训、执业医师及执业护士考前辅导培训、成人高考辅导培训等工作。学院1988年被省教委遴选为护理专业自学考试主考院校，2016年又被省教育厅遴选为药学专业自学考试主考院校。2006年通过了省教育厅对普通高校成人继续教育函授夜大学的合格评估。2008年以后，经云南省卫生厅批复，“云南省乡村医生规范化培训指导中心”在我校挂牌成立，此后，经中国红十字会、云南省教育厅、云南省卫计委等部门的批准、又相继挂牌成立了“中国红十字天使计划乡村医生培训基地”、“云南省校医培训基地”、“云南省卫生监督培训基地”。目前已经形成了多形式、多层次、多规格、多渠道的办学格局。